Bueno, por lo general me suelo tragar todo tipo series por lo que voy a poner mis favoritas por generos. Es verdad que algunas series que pongo abarcan mas generos de los que pongo, pero es para ordenarlas de alguna manera:

Grandes Shonen-->One Piece (para mi por delante de naruto y bleach)
Humor-->Gintama y GTO, aunque como bien apunta TheLegendCatSaul  Tengen Toppa Gurren Lagan tambien es brutal
Suspense e intriga-->Death Note y Code Geass
Psicologico-->Evangelion y Higurashi no Naku Koroni
Accion-->FullMetal y Cowboy Bebop
Amor-->Toradora y School Rumble
Historico-->Bakumatsu Kikansetsu Irohanihoheto(aunque aparezcan ciertos superpoderes)
Samurais--> Shigurui y samurai Shamploo
Ninjas-->Basilisk
Deportivos-->Slam Dunk y Eyeshield 21
Otros shonen-->Gantz, Berserk, air gear, soul eater, hunter x hunter, reborn!, g.gray-man, Chrono crusade, inuyasha, shaman king,To Aru Majutsu no Index,Fate/stay night,...

hala, pues ya me quede agusto, aunque se me olvidan bastantes seguro,...